Vejret kan spille en stor rolle, når du planlægger din rejse til Fuefuki. Husk, at du ofte finder billigere valgmuligheder uden for højsæsonen. August og juli er som regel de varmeste måneder med en gennemsnitstemperatur på 20°C, mens januar og februar er de koldeste måneder med en gennemsnitstemperatur på 2°C. Juli, september, oktober og juni er de mest regnfyldte måneder i Fuefuki. Det regner i gennemsnit 290 mm om måneden.