Det bedste tidspunkt at besøge Prespes er i det sene forår (maj til begyndelsen af juni) og det tidlige efterår (september til begyndelsen af oktober).I disse perioder er vejret behageligt mildt med masser af solskin, hvilket gør det ideelt til udendørs aktiviteter og udforskning af søernes og de omkringliggende landsbyers naturlige skønhed. Du undgår den intense sommervarme og de koldere, til tider snefyldte, vinterforhold. Den unikke flora og fauna er også særligt tydelig i disse mellemsæsoner.For dem, der er interesserede i fuglekiggeri eller vandreture, er det sene forår særligt givende, da mange trækfugle vender tilbage, og vilde blomster er i fuld flor. Stierne omkring søerne, såsom dem, der fører til eremithytten Panagia Portiotissa, er let tilgængelige og tilbyder enestående udsigter.Det tidlige efterår er fantastisk for rejsende, der nyder en lidt roligere oplevelse og de rige farver fra det skiftende løv. Søernes vand er stadig varmt nok til nogle aktiviteter, og de lokale produkter, som bønner og peberfrugter, er på deres højeste.