Det bedste område at bo i på Favignana er omkring hovedbyen, også kaldet Favignana, især i nærheden af havnen og Piazza Madrice.Dette område er øens centrale punkt, hvor du finder den højeste koncentration af faciliteter og tjenester. Det er meget gangbart med smalle, snoede gader, der fører til den travle havn og det centrale torv, Piazza Madrice. Her finder du de fleste af øens restauranter, butikker og steder at leje cykler eller scootere, som er afgørende for at udforske øens smukke bugter og strande. Den tidligere tunfabrik, nu et museum, ligger også kun en kort gåtur derfra.For par, der leder efter en bekvem og engagerende base, er det ideelt at bo nær byens centrum. Du har nem adgang til en bred vifte af spisemuligheder om aftenen, fra fiskerestauranter til pizzeriaer, og kan nyde en afslappet aperitivo på Piazza Madrice. Desuden ligger havnen lige ved siden af til bådture til nærliggende øer som Levanzo og Marettimo.Rejsende, der sætter pris på nem adgang til alt, vil også finde byens centrum perfekt. Det er knudepunktet for offentlig transport og udgangspunktet for mange bådture til øens mest fantastiske badesteder, såsom Cala Rossa og Cala Azzurra.