Du bør næsten tage vejret i El Morro Negro i betragtning, da du på den måde kan få mest ud af tiden ved poolen under dit ophold. Marts og april er som regel de varmeste måneder med en gennemsnitstemperatur på 27°C, mens januar og december er de koldeste måneder med en gennemsnitstemperatur på 25°C. Oktober, august, juni og november er de mest regnfyldte måneder i El Morro Negro. Det regner i gennemsnit 447 mm om måneden.