Det bedste tidspunkt at besøge Caballococha er i tørsæsonen, som løber fra maj til oktober.
I disse måneder er vejret mere forudsigeligt med mindre nedbør, hvilket gør det ideelt til at udforske Amazonfloden og dens bifloder. Flodniveauet er lavere, hvilket blotlægger flere strande og gør det lidt lettere at spotte vilde dyr, da de har tendens til at samles tættere på vandkanten. Denne periode er fremragende for rejsende, der ønsker at maksimere deres tid med udendørs aktiviteter og udflugter.
For dem, der planlægger at besøge i højvandsæsonen (november til april), er der mere regn, men de oversvømmede skove giver et unikt perspektiv, hvilket gør det muligt for både at navigere gennem områder, der normalt er utilgængelige. Dette kan være en fascinerende oplevelse for dem, der er interesserede i en anderledes slags jungleudforskning, med en chance for at se vandliv tættere på.