Akvariets temaer er Sagami-bugten og Stillehavet, de mange forskellige dyr, der lever der, samt livets indbyrdes sammenhæng. Besøgende kan have det sjovt i akvariet, samtidig med at de lærer om havet og dets omgivelser.

Når man træder ind i Enoshima Akvarium, mødes man af udstillinger med fokus på Sagami-bugten, efterfulgt af udstillinger om dybhavet, vandmænd og havdyr. Akvariet tilbyder desuden en række forklaringer, forestillinger og programmer, der giver besøgende mulighed for at interagere med havdyr. Besøgende opfordres til at opleve »overraskelse og spænding« samt »helbredelse« gennem disse aktiviteter. Derudover afholdes der også spændende sæsonudstillinger og midlertidige arrangementer.