Malta National Aquarium har 52 tanke, inklusive krybdyr, insekter og padder, samt middelhavsfisk, inklusive fisk, der ofte kan findes i maltesiske farvande, og historiske artefakter, der kan findes i havene omkring de maltesiske øer. Hovedtanken inde i akvariet måler 12 meter i diameter og indeholder en gennemgangstunnel, der gør det muligt for besøgende at se fisken meget tættere på. En række af Indo-Stillehavsdyr er opstaldet her, herunder sortspidshajer, zebrahajer, rokker og andre eksotiske arter. En ikonisk buet skalstruktur, der ligner skallen af en søstjerne, huser akvariet. Den tilstødende promenade giver fodgængere yderligere rekreative faciliteter, som omfatter et legeområde for børn.