Apollonia blev opført i 588 BC. i de bakker, der allerede var beboet af illyrerne, efter grundlæggelsen af det gamle Dyrrachium. Det var en gruppe græske kolonister fra Korfu og Korinth, under ledelse af Gylax, der grundlagde den. En ung Augustus, endnu ikke kejser, men allerede beskyttet af Cæsar, kom for at studere i Apollonia. Her kom købmænd og lærde mænd, hærførere og religiøse forbi. Byens offentlige bygninger udviklede sig i midten af de to bakker, mellem et område dedikeret til militær træning (Arx) og et område dedikeret til tilbedelse (Temenos). I Temenos finder du Apollo-templet og resterne af nogle monumenter fra det 6. århundrede f.Kr. sammen med et dorisk tempel, lagerbygninger og to små helligdomme. Centrum for Apollonias liv var agora, som indeholdt flere bygninger. Et græsk teater og et monument dedikeret til nymferne, nogle politiske bygninger som Bouleterion, Odeon, biblioteket, Triumfbuen, Dianatemplet og Prytaneion, datidens lille lokale parlament.